医学科学研究方法学是关于医学科学研究方法论的一门科学理论，在医学科学发展为现代实验医学的过程中发挥着极其重要的作用。医学研究对象是人，人的生命活动和疾病过程极其复杂多变，更需注重科学的研究方法学。 医学科学研究方法学是从理论的高度，研究各个医学领域研究方法中那些具有普遍指导意义的共同原则、策略和规律，其基本研究对象不是某一学科的某一方法，而是从更为普遍的角度，研讨如何进行各医学领域科学研究的共同和一般的途径，寻求有关研究课题的最佳方法。