尤怡于仲景之学钻研甚深。其所著《伤寒贯珠集》，对不但对《伤寒论》原文进行了逐条注解，还采用以六经为纲，治法为目，以方类证的方法，对《伤寒论》原文次序做了重新的编排和归类，突出了伤寒治法特色。该书共八卷，就六经各提其纲，于正治法之外，又列各经之变治法。如太阳原出之病以正治之法，其他则赅以权变法、斡旋法、救逆法及类病法等。阳明腑病多于经病，腑病予正治之法，有宜下、宜清、宜温之异；次为明辨法，以攻下及外导润下等法；又其次为杂治法，或散或下以疗病变发黄、蓄血等证。少阳居表里之间，当肓膜之处，外不及于皮肤，内不及于脏腑，有汗吐下之戒，惟小柴胡汤方和解表里，为少阳正治之法；其次则有少阳权变法，和解而兼汗、下之法；又其次为刺法。太阴中风则以桂枝汤发汗之法；经脏俱病之证，与先里后表之法。